Categories
Podcasts SciCast Stiinta

Tehnocultura SciCast 007 – Virusul, prieten și dușman


Tehnocultura SciCast 007 a fost înregistrat duminică, în data de 29 mai 2016, în Londra, Marea Britanie.

Subiectul principal al acestui episod: virusul.

Audio podcast pe iTunes:
https://itunes.apple.com/ro/podcast/tehnocultura/id929951093?mt=2

Video pentru virusuri:

Virusurile sunt coniderate unități biologice care nu au viață. Se consideră că viața începe de la celule în sus, deși virusurile se replică și sunt supuse selecției naturale. Comparativ cu bacteriile, virusurile sunt de zeci sau sute de ori mai mici iar bacteriile sunt de sute de ori mai mici decât o celulă umană.

Un virus obișnuit este compus dintr-un înveliș proteic numit capsidă în interiorul căruia se află codul gentic, ADN sau ARN. Anumite tipuri de virus au un strat protector în plus care acoperă capsida precum este virusul HIV. Acel strat în plus este o membrană numită înveliș viral. HIV are și alte proteine în interiorul capsidei care ajută la replicare și la inserarea codului său genetic în interiorul codului genetic al gazdei. Asemenea virusuri se numesc retrovirusuri.

Un podcast numai despre virusuri: TWIV.

Virusurile după codul genetic:
– ADN, un un singur lanț de cod ADN sau dublu helix
– ARN, cu un singur lanț de cod genetic sau dublu helix

Virusurile după ciclul de viață:
– ciclul de viață litic
– ciclul de viață lisogenic

Transmisie:
– insecte: dengue
– contact: ebola
– sexuală: HIV

Generalități:
BBC: un sumar despre virusuri
Dmitri Ivanovski, 1892, a descris un patogen care ar trebui să fie mai mic decât o bacterie
– suntem mai mult virus și bacterie decăt oameni Tehnocultura.ro
– planeta dominată de virusuri (Daily Galaxy / Why Evolution Is True): 10^32 virusuri pe planetă, Există aproximativ 100 000 de elemente în genomul uman a căror origine o poți găsi într-un virus antic și de demult. Acele elemente fac 8% din codul nostru genetic și este cod genetic lăsat în urmă de virușii cu care s-au întâlnit oamenii de-a lungul sutelor de mii de ani. Doar 1.2% din codul nostru genetic este conținut de gene care au rolul de a genera proteine. Într-un fel, noi suntem mai mult viruși decât suntem oameni.

Pandemia de gripă din 1918 a ucis 50 de milioane de oameni din toată lumea și se presupune că bolile aduse de europeni când America a fost descoperită au ucis 95% din populatia indigenă ( din cauza variolei, gripei, difteriei, pojarului,) între 10 și 100 de milioane de nativi.
– virusurile pot genera compotamente ciudate în animale, gen omida zombie
Scientific American: animalele placentare pot crește descendenți în placentă datorită unui retrovirus, practic acel retrovirus (endovirus) permite dezvoltarea placentei (Nature, sep 1999: sincitina, proteină generată de retrovirus, permite formarea placentei. Retrovirusul se numește – human endogenous defective retrovirus, HERV-W)
New Scientist: avem de la virusuri proteinele sincitină și EFF-1, proteine care permit celulelor să se unească în grupuri mari și să creeze organe, cum sunt mușchii sau pielea. Cu alte cuvinte, fără viruși nu am fi evoluat în organismele complexe de acum. Acele proteine permit virușilor să rupă membrana celulelor, motiv pentru care acele proteine sunt bune și pentru distrugerea membranelor celulelor care sunt în interiorul unui grup de celule.
iarna nu răcim din cauza frigului, ci din cauza mutiple,or tipuri de virus care ne pot da răceala (rhinoviruses, coronaviruses, parainfluenza viruses, and adenoviruses)
clasificări ale virusurilor: virus, virologie, comparatie virus – celulă, dimensiuni 30 – 300nm (electron microscope cca. 1931, Ernst Ruska and Max Knoll), diferite forme, viroizi (afectează plante) și prioni (afectează animale, Crutzfeld-Jakob în oameni), replicare, ciclul litic – ucide celula, ciclul lisogenic – nu ucide mereu celula, origine (cod genetic din celule, au evoluat împrună cu celulele, visururi lisogenice aka oncovirusuri ( virusul T limfotropic – leucemie, hep B – cancer la ficat, hpv – cancer cervical
virusurile afecteaza toate cele trei domenii ale vieții : domeniul archeae – extremofile (metonogene, termoacidofile) care sunt procariote (pro, “înainte de” de nucleu), domeniul bacteriilor – cianobacterii, firmicute, spirochete (procariote), domeniul eucariotelor (ciuperci, plante, animale, chromaleolata )
ciclul de viață rezumat în acronimul (C)AESAR – attachment, entry, synthesize, assembly, release (HIV are două enzime: transcriptaza inversă, integrază )
– ciclul de viața al HIV: se lipește de celulele T ale sistemului imunitar cu ajutorul unor proteine-receptor de la suprafața sa, trece apoi prin membrana celulară în interiorul celulei unei capsida ste dizolvată de cărte celulă, apoi transcripaza inversă genereaza un lanț ADN din codul ARN, proces care duce și la generarea de erori de traducere, lanțul de ADN crat este unit cu un alt lanț ADN pentur a crea o structură dublu helix, apoi enzima integrază iar codul genetic astfel realizat și îl duce în nucleaul celulei unde în integrează în codul ADN al celulei.

Pentru a crea o dublură a virusului HIV tot ce este nevoie este ca o enzimă numita polimeraza ARN să citească codul viral, să creeze corespondentul mARN, care mARN este dus către ribozomi în celulă unde se creează proteine care vor fi folosite la învelișurile viitoarelor virusuri și la capside. Aceste proteine sunt direcționate către suprafața celulelor împrreună cu alte copii ale codului mARN care vor deveni viitorul virus.


AK lectures are un întreg curs despre celule și virusuri: pentru a cunoaște virusurile trebuie să știi cum funcționează celulele


legat de HIV: trebuie urmărit eposodul Pacientul Zero de la RadioLab / pacientul zero ep Tehnocultura.ro:

– virus rap – Glenn Wolkenfeld:

– documentare: Flu Attack / Virus evolution / The Age of Viruses / Virus documentary

Viromul uman sau flora virală:
un exemplu de studiu: Emerging View of the Human Virome, Kristine M. Wylie, George M. Weinstock, and Gregory A. Storch
prezentare video Frederick Bushman: slide-urile de la prezentare / bio Frederick Bushman / studiu citat în prezentare: PLOS One – Conservation of Gene Cassettes among Diverse Viruses of the Human Gut. Video:

tipuri de virusuri din cadrul viromului uman: virusurile pot fi găsite oriunde (sursă imagine via ResearchGate.net) / studiul: Describing the Silent Human Virome with an Emphasis on Giant Viruses
INT354561.indd

– prezentare video despre viromul uman făcută de Katherine Wu, de la Harvard: prezentare powerpoint a sldie-urilor din video (pdf) / video, vezi minutul 40


Utilitatea virusurilor și tehnici de combatere a virusurilor periculoase:
(viroterapie) terapie cu gene cu ajutorul retrovirusurilor, prezentare Shirlee Wohl, minutul 30: Shirlee Wohl la Harvard / studiu la care a participat: Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmission during the 2014 outbreak. Video, vezi minutul 30:


(viroterapie) antibacterian cu ajutorul bacteriofagilor: primul test în 2009, împotriva unei bacterii ce infecta urechea: A controlled clinical trial of a therapeutic bacteriophage preparation in chronic otitis due to antibiotic-resistant Pseudomonas aeruginosa; a preliminary report of efficacy.

VirScan, de la Harvard: cu un cost minim afli ce virusuri te-au infectat de-a lungul vieții tale. Se folosește de bacteriofagi pe care pun proteine specifice multor virusuri și apoi verifică probele de sânge pentur a vedea acă anticorpii prezenți interacționează cu unii dintre bacteriofagi. Dacă înteractionează, atunci știm că ne-am întâlnit cu virusul respectiv în trecut / studiu Science / articol Harvard / video:

VirScan works by exposing a drop of blood onto a bacteriophage populated with peptides, the protein targets antibodies in the immune system attack and hook onto. If there is an antibody in that blood sample related to one of the 1,000 virus strains coded into the bacteriophage, it will seek it out and bind to the related protein. The test then collects up all the antibodies and the matter they have bound to. That matter — made up of the proteins the antibodies have clung to — are then sequenced to identify the viruses.

– viroterapie oncolitică: folosirea virusurilor pentru a combate cancerul


– cearea de virusuri articifiacle pentru combaterea bolilor: studiu Science – Chemical Synthesis of Poliovirus cDNA: Generation of Infectious Virus in the Absence of Natural Template


– vaccinuri: oameni de știința de la The Scripps Research Institute, Harvard, MIT au început lucrul la un vaccin anti-HIV / studiu
vaccinurile și experimentele umane:

– un întreg episod despre vaccinuri, fie împotriva virusurilor, fie împotriva bacteriilor: Tehnocultura TVS 006
vaccinurile nu cauzează autism / mișcarea antivaccin este unul dintre cele mai odioase lucruri care se pot petrece în România
medicamente antivirale: molecule ce se lipesc de receptorii de la suprafața virusurilor, inhibitori ai deintegrării capsidelor(virusul nu poate ieși din capsidă), blocarea activității transcripatei inverse, atacarea integrazei, altele blochează transcripția mARN, folosirea ribozimelor care taie mARN în locuri care deactivează virusul, inhibitori de protează (care unește proteinele generate de celulă și creează capsida) ori imunoterapie

Întrebarea săptămânii: am auzit ca pietrele emit unde eelctromagnetice. Este adevărat?

Da, s-a discutat despre acest lucru in episodul despre black body radiation radiația corpului negru.

În caz că nu știai orice obiect care are temperatura mai mare de 0 Kelvin emite unde electromagnetice sub forma radiației termice. Astfel, o piatră emite unde electromagnetice cu maxim de intensitate în zona spectrului infraroșu, dacă avea piatră este într-o zonă unde temperatura este de aproximativ 20 de gradeo Celsius (300 K).

Radiația emisă de orice corp cu temperatura mai mare de 0 K se numește radiația corpului negru (engleză: black body radiation).

Despre radiația corpului negru ne povestește Conf. Dr. Nicolae Crețu, de la Universitatea “Transilvania” Brasov, Laboratorul Fizică Aplicată și Computațională.

Acest fenomen a fost pus în evidență de Max Planck, în 1900, când a făcut experimentul cu o cutie din care ieșeau unde electromagnetice în spectrul infraroșu atunci când acea cutie metalică era încălzită.

Fiecare corp emite unde electromagnetice, inclusiv oamenii, tocmai de aceea omul apare roșu-albastru-negru în camerele ce văd în infra-roșu.

Wilhelm Wien este cel ce a stabilit, în 1893, că, atunci când un corp emite unde electromagnetice, acel corp emite în tot spectrul radiației, dar că există un maxim al intensității la anumite lungimi de undă.

Maximul de intensitate apare la o anumită lungime de undă care poate fi calculată cu formula:
λ = 0,0029 / T
λ – lungimea de undă
T – temperatura în Kelvin

Astfel, un om care are temperatura corpului de 37,5 grade Celsius emite unde electromagnetice cu maximul de intensitate la lungimea de undă:
λ = 0,0029 / 310,65 = 9,335 micrometri = 9335 nm, spectrul IR apropiat

Minutul de tehnologie

Extreme Tech: Microsoft continuă procesul de update la Win 10 chiar dacă dai clic pe butonul X roșu
JayzTwoCents: Overclockul la plăcile video și la procesoare nu este nociv
Computerphile: ce sunt dischetele floppy, acele dispozitive de stocare magnetică celebre până în anul 2000
Security Now ep 561: Google va bloca Flash în browserul Chrome
SmithsonianMag: programul nucreal al SUA încă folosește dischete de 8 inci (uimitor: cum nu există tehnologie care să citească acele dischete, progranmul nuclear este protejat)
Science Daily: folosirea dronelor în cercetări științifice în natură
TechDirt: Google se luptă cu Creative Labs, un troll al brevetlor, pentru dreptul nostru de a asculta muzică pe dispozitivele mobile. Creative Labs dă în judecată tot feluld e firme pentru că organizează melodiile în mod ierarhic după care le poți asculta
Interesting Engineering: Google prezintă proiectul ARA prin care promovează telefoanele modulare
EEVblog #883 – Orange Pi One vs Raspberry Pi 2

Știri din lumea științei

Science Alert: imunoterapie: combati cencerul cu celulele albe ale altei persoane
Scholarly OA: MDPI, un alt jurnal fraudulos de care să te ferești. Publică aiureli de genul putere entropică, jocuri cuantice / La fel și cu Science Publishing Group
SmithsonianMag: Chinezii avea bere în urmă cu 5000 de ani
BBC: cel mai amre radiotelescop este în construcție în China. Se numește 500m Aperture Spherical Telescope aka Fast. / Diametrul 500 de metri
Science Channel: apa de pe Marte este extrem de sărată

Despre ce se mai discută în lumea pseudoștiinței?

SlepDic: Dr. Joe Mercola vinde “personal power plate” un aparat inutil care, cică, ar trebui să stimuleze vibrațiile naturale ale corpului tău pentru a se vindeca. O altă șalrlatanie marca Mercola. / Despre șarlatanul Mercola

Bonus

TED-Ed: despre numerele iraționale
TIFO: care este diferența dintre ulei virgin, extra-virgin și rafinat
NASA Goddard: furtunile solare ar putea fi una dintre cauzele apariției vieții pe Terra
SciShow: adevărul despre 10 invenții celebre
Universe Today: care este cel mai înalt loc de pe Terra? Mt. Chiborazo, cu altitudinea 6,263.47 metri la care adaugi 21 de kilemtri, diferența dintre raza planetei la ecuator și cea de la poli.
Tom Scott: de ce zăpada și confetii distrug calitatea filmelor?
Compound Chem: de la ce provin culorile din pietrele prețioase?
Fraser Cain: putem avea stele reci?
Crisia.net: Sfatul farmacistului: citește despre diferențele dintre medicanete generice și cele de brand și află ca poți cere varianta mai ieftină a medicamentului
SCiShow: substanțe antimicrobiene descoperite la animale

Vizitează

Tehnocultura pe Facebook
Grupul știința pe Facebook și Știința pe Facebook
Grupul Știința, candelă în întuneric
Grupul Pseudoștiința pe Facebook

Categories
Online

Lupta împotriva virușilor și lupta pentru internet

Am stat mai bine de o oră și ceva să îmi fac contul la TED și să mă joc cu setările de acolo. Cât de curând voi scrie un articol dedicat TED, unul dintre cele mai interesante site-uri unde poți afla informații interesante din tot felul de domenii sub forma unor prezentări video.

Am urmărit cu interes două discuții: una despre virușii de calculator cu o scurtă istorie a lor și una despre dominația asupra cyberspațiului.

În prima discuție video Mikko Hypponen, liderul cercetărilor la F-Secure Corporation din Finlanda, întreabă: care este următorul virus devastator și va putea oare lumea să îi facă față?

El ne poartă printr-o scurtă istorie legată de viruși, de la primul virus, Brain.A, inventat de doi pakistanezi, până la Stuxnet. Mi-a plăcut că a prezentat câteva exemple de viruși în acțiune și modul în care se poate afla semnătura celui care i-a creat.

Concluzia generală a discursului este că e aproape imposibil să dai de cei ce fac asta și că am avea nevoie de o forță globală care să prindă din timp infractorii cibernetici. Mie îmi sună a control excesiv și aș fi de acord să se angajeze câteva companii private care să afle identitatea reală a infractorilor ca apoi să intre în acțiune autoritățile.

Urmărește un film interesant despre virușii de calculator și mica lor istorie:

În următorul film aflăm câteva detalii interesante despre luptele de dominație care se dau în lumea cyberspațiului. Mai precis, este vorba de controlul pe care guvernele autoritare și giganții internetului îl au asupra mediului online. De curând am zis că mă bucură apariția Google+ nu pentru că este ceva nou, ci pentru că oferă o alternativă și nu mai depindem doar de o anumită platformă.

Rebecca MacKinnon, prezentatoarea următorului discurs, este Senior Fellow la New America Foundation și activist media. Ea discută despre lupta dintre libertate și control asupra internetului. După cum știu unii dintre noi, internetul a fost creat pentru a fi o punte de comunicare liberă pe tot Globul și orice fel de limitări, gen Marele Zid de Foc (firewall) al Chinei, este împotriva eticii online-ului.

Întregul discurs se centrează asupra întrebării: cum proiectăm următoarea fază de dezvoltare a internetului în așa fel încât să avem în centrul său responsabilitatea și libertatea și nu controlul? Ne putem bucura că încă la noi este liber internetul, cu toate că apar aberații în genul celei de care s-a pomenit ieri pe Refresh.ro.

Rebecca MacKinnon ne invită să luăm înapoi internetul:

Cum vezi internetul? Eu îl văd ca un punct central al ceea ce fac: comunicare, învățat, muncă și joacă! Cu cât învăț mai multe despre el, cu atât voi fi în stare să apăr valorile de bază ale acestuia!

Nu uita, până pe 25 iulie 2011 am un mic concurs pe blog în care poți câștiga reducere de 75% la hosting. Vezi aici despre ce e vorba.

Categories
Cultura Tehnologie

Anatomia unui virus de calculator și cyberactivismul

anatomia-unui-virus-calculator-arma-cibernetica-codToți știm că un virus de calculator este ca un șobolan în casă: nu este de dorit. Cel mai interesant este atunci cânt acel virus este capabil să distrugă întregi rețele sau să preia controlul unor centrale nucleare, cum a fost cazul cu Stuxnet.

Un virus nu este altceva decât un program creat să ruleze după anumiți parametri. Trebuie să știi că sunt multe mai multe tipuri de fișiere care sunt executabile. Și nu mă refer aici la .exe, .cmd, .bat sau altele cunoscute. O listă măricică o găsești aici. De ce am făcut referire la asta? Pentru că un virus de genul Stuxnet poate fi în calculatorul tău fără să îți dai seama.

Cei de la Geeksaresexy au prezentat un film interesant făcut de către Patrick Clair în care ni se explică modul în care funcționează un asemenea virus. Via [Dr. Optix].

Stuxnet: Anatomy of a Computer Virus from Patrick Clair on Vimeo.

După cum vezi situația este cât se poate de serioasă și trebuie să fim atenți la ce luăm de pe internet. Un mic sfat: nu da clic peste tot! Firewall-ul și antivirusul să fie mereu active.

Dacă Stuxnet se folosește de internet ca să lanseze atacuri, atunci guvernele își pun la punct adevărate departamente de protecție împotriva cyber-războaielor, lupte care se pot duce prin internet cu ajutorul unor asemnea viruși. Trebuie să amintesc că înainte de a invada Georgia, Rusia a pus la punct un atac cibernetic asupra comunicațiilor georgiene cu aproape două luni înainte. Urmărește filmul de mai jos pentru detalii. Uimitor ce poate face un cod viu!

Cyber Activism – Operation Titstorm from Patrick Clair on Vimeo.